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浙大建立我國(guó)首個(gè)自行開(kāi)發(fā)水稻基因數(shù)據(jù)庫(kù)

發(fā)布時(shí)間:2001-12-18來(lái)源:作者:3425


    中國(guó)浙江網(wǎng)12月18日消息 我國(guó)水稻基因研究又獲新成果。筆者12月17日從浙江大學(xué)獲悉,該校生物技術(shù)研究所已率先在國(guó)內(nèi)獨(dú)立開(kāi)發(fā)出了目前國(guó)際上通量較高的生物芯片之一、容量為13400點(diǎn)的水稻基因芯片,同時(shí)還完成了36000余個(gè)水稻基因片斷的分離、測(cè)序和分析,并在國(guó)際權(quán)威基因庫(kù)的水稻EST(基因表達(dá)序列標(biāo)簽)數(shù)據(jù)庫(kù)中發(fā)布了20381條EST序列,占總量的19.5%。這是我國(guó)第一個(gè)自行獨(dú)立建立和開(kāi)發(fā)的水稻基因片斷數(shù)據(jù)庫(kù),其中水稻胚乳特異表達(dá)基因片斷數(shù)據(jù)庫(kù)為國(guó)內(nèi)外首創(chuàng)。此外,該所還成功申報(bào)了48個(gè)具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的基因?qū)@?,建立開(kāi)發(fā)了有我國(guó)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的數(shù)據(jù)分析軟件“菩薩蠻”。
      
      “水稻基因芯片開(kāi)發(fā)及生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)建立”,是科技部國(guó)家研究與開(kāi)發(fā)專(zhuān)項(xiàng)課題和省科技計(jì)劃重大項(xiàng)目。1999年,浙大生物技術(shù)研究所開(kāi)展該項(xiàng)課題后,通過(guò)課題組成員李德葆教授提出的模塊表達(dá)序列標(biāo)簽技術(shù),加快了水稻基因全長(zhǎng)的克隆與鑒定,提高了實(shí)驗(yàn)效率并且節(jié)省克隆基因所需要的科研投入。
    
      據(jù)介紹,目前國(guó)際上一些重要的數(shù)據(jù)庫(kù)及生物信息學(xué)軟件包已實(shí)行有償使用,并開(kāi)始對(duì)工業(yè)用戶(hù)收費(fèi)。因此,生物信息軟件開(kāi)發(fā)以及相應(yīng)的技術(shù)服務(wù)可以產(chǎn)生巨大的經(jīng)濟(jì)效益。浙大這次獨(dú)立開(kāi)發(fā)的EST數(shù)據(jù)庫(kù)不僅具有廣闊的市場(chǎng)前景,而且還為改變我國(guó)在生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)和分析系統(tǒng)方面的被動(dòng)局面作出貢獻(xiàn)。而水稻基因芯片的研制成功,將加快新型農(nóng)產(chǎn)品開(kāi)發(fā)和新型農(nóng)藥除草劑的篩選,為優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、多抗作物育種提供有效手段,為研究分析作物性狀特性、機(jī)理和功能基因組研究提供基礎(chǔ)材料。(通訊員 婁沂春 記者 馬瑛瑛)