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全球調(diào)查顯示:栽培水稻“返祖”現(xiàn)象普遍存在

發(fā)布時(shí)間:2020-04-17來(lái)源:浙大新聞辦作者:柯溢能1336

返祖現(xiàn)象也稱(chēng)野化或去馴化,是生物界經(jīng)常發(fā)生的一個(gè)遺傳現(xiàn)象,指栽培作物和家養(yǎng)牲畜等從人工環(huán)境回歸自然環(huán)境,恢復(fù)野生特征。

就栽培水稻而言,去馴化后成為雜草稻。雜草稻呈現(xiàn)出子實(shí)變小、紅皮的特征,經(jīng)過(guò)環(huán)境適應(yīng)進(jìn)化具有落粒特征,種子成熟即散落田間,之后與水稻耕作生長(zhǎng)季節(jié)與栽培稻伴生。這種“山寨版”的水稻作為稻田惡性雜草,嚴(yán)重影響水稻生產(chǎn),被形象的稱(chēng)為“鬼稻”。

經(jīng)過(guò)三年多的努力,浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院樊龍江教授領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究團(tuán)隊(duì),對(duì)涵蓋各大洲來(lái)自16個(gè)主要水稻生產(chǎn)國(guó)的稻區(qū)都進(jìn)行了抽樣,在對(duì)524份雜草稻的研究中發(fā)現(xiàn)水稻在世界各稻區(qū)均存在去馴化現(xiàn)象。這項(xiàng)調(diào)查也對(duì)水稻進(jìn)化、資源利用和雜草稻防控具有重要的意義。

相關(guān)研究成果近日在線(xiàn)發(fā)表在開(kāi)放獲取期刊《基因組生物學(xué)》(Genome Biology)上。

全球稻區(qū)雜草稻材料采集地區(qū)和數(shù)量分布


返祖現(xiàn)象是進(jìn)化的必然

通過(guò)基因組重測(cè)序,并結(jié)合已有當(dāng)?shù)卦耘嗟竞鸵吧净蚪M數(shù)據(jù)資源,在對(duì)樣本群體遺傳學(xué)分析后發(fā)現(xiàn),全球稻區(qū)發(fā)生的雜草稻都來(lái)自栽培稻,而且這個(gè)去馴化過(guò)程是一個(gè)持續(xù)的過(guò)程。

一般認(rèn)為,水稻的起源歷程,從野生經(jīng)過(guò)馴化,以及現(xiàn)代遺傳育種改良便結(jié)束了。因此有的科學(xué)家認(rèn)為雜草稻與栽培稻只是“近親”,沒(méi)有直接的血緣關(guān)系。但中外學(xué)者的這項(xiàng)最新研究把人類(lèi)對(duì)作物發(fā)展的歷史又向前延伸了一段。

人們對(duì)作物回歸野生狀態(tài)的認(rèn)識(shí),對(duì)于防控雜草稻有積極的作用?!狈埥硎荆磕晔崭钏緯r(shí)都會(huì)有種子落粒,田里種子數(shù)量越多,進(jìn)化出雜草稻的概率越大。因此,減少田間種子遺留的庫(kù)容,是減少雜草稻的重要手段。

為什么進(jìn)化中會(huì)出現(xiàn)返祖現(xiàn)象?

研究結(jié)果表明,這是適者生存的自然選擇。隨著人們對(duì)水稻高產(chǎn)的不斷改良,谷粒變大且不易脫落,這樣一來(lái)便于收割增產(chǎn)提效。但這一改良滿(mǎn)足了人類(lèi)需求卻改變了水稻的生存法則——原有的繁衍生存機(jī)制被破壞。

因此,雜草稻需要不斷適應(yīng)新的變化,讓自己生存下來(lái)?!奥淞J欠N子回歸土壤實(shí)現(xiàn)繁衍的關(guān)鍵一步,是在自然界生存最重要的機(jī)制。同時(shí)將種子變小,也是為了便于傳播生長(zhǎng)?!狈埥忉?。

為了自身物種的繁衍,趨向于野生特征,是不可抗拒的大趨勢(shì)。這也就是為何雜草稻恢復(fù)脫落生長(zhǎng)的重要原因。

去馴化是作物不可避免的進(jìn)化機(jī)制。”樊龍江介紹,這一過(guò)程在各地歷史上持續(xù)多次發(fā)生,甚至有些發(fā)生在綠色革命(即矮化育種)之后。

亞洲雜草稻群體來(lái)源于若干主要栽培稻品種(founder)。右圖包括其中一個(gè)起源品種——“南京11”的選育系譜(上)及其與27份雜草稻材料(分別來(lái)自江蘇、浙江和廣州)的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系(下)


雜草稻的危害來(lái)源于極強(qiáng)的競(jìng)爭(zhēng)力

雜草稻在我國(guó)大面積發(fā)生,特別在江蘇、廣東、遼寧和寧夏等地,雜草稻成為我國(guó)稻田除稗草外,最嚴(yán)重的雜草。

究其原因是雜草稻隨水稻耕作生長(zhǎng)季節(jié)與栽培稻伴生。此前的研究已經(jīng)表明,雜草稻在有限的空間中與栽培稻開(kāi)展競(jìng)爭(zhēng),比如爭(zhēng)水分、爭(zhēng)光照、爭(zhēng)養(yǎng)料。由于其遺傳背景與栽培稻極其相似,除草劑難以根除,給水稻生產(chǎn)帶來(lái)極大影響。

雜草稻為何能這般神出鬼沒(méi)?

這很大一部分原因,要從其雜交起家的遺傳背景說(shuō)起。

在這次調(diào)查中,科研人員發(fā)現(xiàn)全球特別是在南美稻區(qū),有大量雜交起源的雜草稻,它們或是雜草稻之間或是雜草稻與栽培稻之間雜交。這種雜交,導(dǎo)致雜草稻同樣獲得了除草劑的抗性等??蒲腥藛T建議,要盡可能防止不同水稻品種間的串粉,加強(qiáng)對(duì)育種過(guò)程的管控來(lái)減少雜草稻的出現(xiàn)。

難以除凈雜草稻的另一個(gè)原因就是從外形上很難區(qū)別,在苗期雜草稻就與栽培稻“較勁”,抽穗之后還會(huì)率先成熟。

樊龍江認(rèn)為,水稻通過(guò)稻苗移栽能夠很好的防控雜草稻。育秧讓水稻苗已經(jīng)長(zhǎng)得很大,這樣一來(lái)雜草稻不容易趕上新插的秧。“現(xiàn)在水稻種植大多采用直播,省時(shí)省力。缺點(diǎn)就在于給了雜草稻與栽培稻一起發(fā)芽的機(jī)會(huì),相同的‘起跑線(xiàn)’,這也就是為什么雜草稻越來(lái)越多的原因之一?!?/span>


在危機(jī)中找到未來(lái)水稻育種的機(jī)遇

雜草稻的危害性還來(lái)自于休眠特征,也就是說(shuō)在一定條件下能夠度過(guò)田間冬季的嚴(yán)酷環(huán)境,直到稻季才發(fā)芽。

這樣年復(fù)一年的結(jié)果就是雜草稻越來(lái)越多,終成大害。樊龍江介紹:水稻長(zhǎng),它就長(zhǎng)?!叭绻粔K地閑置兩年重新種植水稻,雜草稻又會(huì)‘復(fù)活’?!?/span>

這種能力來(lái)自于從休眠中“覺(jué)醒”的種子及其強(qiáng)勁的發(fā)芽勢(shì)。科學(xué)家們很希望將這種“發(fā)芽率高長(zhǎng)勢(shì)強(qiáng)”的優(yōu)點(diǎn)應(yīng)用到水稻育種當(dāng)中,通過(guò)提高自然適應(yīng)能力,為增產(chǎn)增收開(kāi)辟新的思路。

研究發(fā)現(xiàn)全球不同地區(qū)雜草稻存在一個(gè)共同的強(qiáng)烈基因組分化區(qū)域,即7號(hào)染色體一個(gè)0.5Mb區(qū)間。該區(qū)域包括與種子休眠、抗性相關(guān)基因等,對(duì)雜草稻環(huán)境適應(yīng)非常重要。此外,休眠性相關(guān)基因經(jīng)歷平行進(jìn)化,在粳型雜草稻和栽培稻間分化明顯,可能在不同雜草稻群體野化過(guò)程中扮演重要作用。

化危機(jī)為轉(zhuǎn)機(jī),中外科學(xué)家在對(duì)雜草稻的研究中不斷尋覓新的育種方向。

栽培稻從野生稻馴化過(guò)來(lái),是人類(lèi)對(duì)其基因的重新選擇。而去馴化過(guò)程,雜草稻發(fā)生了新的基因突變。在基因組選擇信號(hào)分析發(fā)現(xiàn),野化選擇的區(qū)域與馴化選擇的區(qū)域重疊率很低。

舉個(gè)最典型的落粒的例子。人工選擇水稻的基因靶點(diǎn)是sh4,但在對(duì)雜草稻的分析中,這個(gè)位點(diǎn)雜草稻并沒(méi)有發(fā)生變化,但它卻又恢復(fù)了落粒?!斑@也就是說(shuō)明作物野化過(guò)程中的環(huán)境適應(yīng),其進(jìn)化的機(jī)制不一樣。”

浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院邱杰博士(現(xiàn)任教上海師范大學(xué))、博士生賈磊和吳東亞為該論文共同第一作者,樊龍江教授和美國(guó)華盛頓大學(xué)Kenneth Olsen教授為通訊作者。來(lái)自中國(guó)、美國(guó)、巴西、意大利、日本、澳大利亞、馬來(lái)西亞、菲律賓等國(guó)內(nèi)外12個(gè)研究團(tuán)隊(duì)參與了該研究。

(文 柯溢能/圖片由課題組提供)